La Science Chrétienne articule un système théologique distinct centré sur la primauté de l'Esprit et la conviction, partagée par ses adhérents, qu'une juste compréhension spirituelle peut transformer l'expérience humaine, y compris la santé physique. Les adhérents lisent la Bible à travers le cadre interprétatif fourni par Mary Baker Eddy dans Science et Santé avec Clé des Écritures (publiée pour la première fois en 1875). Au sein du mouvement, cette œuvre fonctionne comme un compagnon de la Bible : les lectures en congrégation et les sermons associent fréquemment un passage biblique à une lecture du texte d'Eddy. Cet agencement canonique — un texte scripturaire associé à la clé interprétative d'Eddy — organise le contenu doctrinal de la tradition.
Au cœur de la métaphysique de la Science Chrétienne, enseignent les adhérents, se trouve l'idée que Dieu est un Esprit infini et que le monde matériel, y compris la maladie et la mort, est en quelque sorte une illusion ou une erreur. Les adhérents soutiennent que ce qui apparaît comme maladie est finalement une fausse croyance ou une méprise sur la nature de la réalité ; ils maintiennent que corriger l'erreur au niveau de la pensée — par une compréhension spirituelle scientifique et priante — peut aboutir à une guérison physique. Le langage de "science" dans le nom de la tradition est donc théologique : la tradition utilise "science" pour encadrer la guérison spirituelle comme une pratique législative et découvrable plutôt que comme un simple sentiment ou un miracle charismatique.
Les adhérents articulent un récit différent de la condition humaine et du salut par rapport à ce qui est courant dans de nombreuses dénominations chrétiennes traditionnelles. Alors que beaucoup de ces dénominations parlent souvent de péché, d'expiation et d'une vie après la mort centrée sur la grâce divine médiée par des sacrements ou la foi, la Science Chrétienne réoriente le discours sur le salut vers la correction de l'ignorance par l'illumination spirituelle. Les adhérents mettent l'accent sur la transformation morale et les fruits pratiques d'une pensée correcte : harmonie, santé et clarté morale. La tradition se trouve ainsi en tension productive avec les doctrines chrétiennes orthodoxes concernant l'incarnation et le statut de la matière ; de nombreux Scientifiques Chrétiens lisent la Bible de manière allégorique à des points où les chrétiens conventionnels s'attendent à des lectures littérales.
La Science Chrétienne incarne une orientation éthique clairement articulée. Les adhérents décrivent la vie morale comme étant entrelacée avec l'insight métaphysique : aimer Dieu et son prochain, c'est vivre en accord avec les faits spirituels que décrit Eddy. Cela produit des injonctions pratiques qui incluent l'honnêteté, la compassion, la non-représailles et une vie disciplinée de prière et d'étude. Étant donné que la tradition accorde une grande valeur à la guérison par la prière, la relation entre l'éthique et la santé devient particulièrement proéminente au sein du mouvement : les défauts moraux ou les croyances erronées sont souvent interprétés comme des obstacles à la guérison qui doivent être corrigés par un travail spirituel.
La tradition contient également une ecclésiologie distincte. Les membres de l'Église sont organisés en églises de branche et sont censés participer aux services hebdomadaires, à la prière collective et aux groupes d'étude. Le rôle de la Bible et de Science et Santé dans le culte crée un rythme de lecture et d'interprétation qui est central à la vie communautaire. Au sein du mouvement, un poids théologique inhabituel est accordé à l'autorité des écrits d'un fondateur : les adeptes considèrent l'œuvre d'Eddy comme une clé des Écritures, ce qui soulève des questions herméneutiques continues sur l'interprétation et les limites du commentaire autorisé.
Sur la question des sacrements et du clergé, la Science Chrétienne diffère nettement de nombreuses dénominations chrétiennes. Le mouvement ne pratique généralement pas les rites sacramentels tels que le baptême ou la communion dans le sens traditionnel. Au lieu de cela, son culte met l'accent sur les lectures, les témoignages de guérison, les hymnes et les sermons. De même, le bureau du pasteur ou du lecteur est distinct ; le clergé ordonné tel que conçu dans de nombreuses autres églises est absent sous la même forme. L'autorité est exercée par le biais des structures de gouvernance de l'église et par le bureau d'enseignement, mais il y a moins de signes ritualisés qui reflètent le christianisme sacramentel.
La position du mouvement envers la science médicale et la médecine a été l'une de ses doctrines les plus controversées. Historiquement, la Science Chrétienne a enseigné que la prière est le principal moyen de guérison et a conseillé de compter sur le traitement spirituel. Cette position a été contestée au sein du mouvement, où certains adhérents utilisent des soins médicaux en parallèle avec la prière, et a été opposée par de nombreux professionnels de la santé et par les autorités étatiques à diverses époques. Les recherches soulignent que les enseignements du mouvement ne prohibent pas uniformément le traitement médical ; plutôt, la pratique varie, et les conflits juridiques découlent souvent de cas spécifiques où la dépendance à la prière plutôt qu'à la médecine est devenue une question de santé publique ou de bien-être des enfants.
Des perspectives comparatives éclairent à la fois les affinités et les différences. Les observateurs notent que la Science Chrétienne partage avec la Nouvelle Pensée et d'autres mouvements métaphysiques un accent sur la causalité mentale et la guérison spirituelle, mais elle est plus explicitement biblique que de nombreux groupes de Nouvelle Pensée et revendique un fondateur unique dont les écrits sont considérés comme canoniques. Comparée au protestantisme traditionnel, le déni métaphysique du mouvement concernant la réalité ultime de la matière et sa lecture anti-matérialiste de la maladie la distinguent, produisant les types de tensions doctrinales qui ont informé les controverses publiques et les réponses œcuméniques.
Une diversité de croyances existe au sein de la Science Chrétienne : certains adhérents lisent les écrits d'Eddy de manière plus littéraliste, d'autres adoptent une herméneutique plus flexible qui permet des soins médicaux ; certaines congrégations mettent l'accent sur la tradition des témoignages de guérison, tandis que d'autres se concentrent sur l'engagement social ou l'éducation. Le mouvement a également évolué interprétativement à travers les générations ; les débats du vingtième siècle sur le rôle du langage technique dans les écrits d'Eddy, ou sur la place des femmes dans le leadership de l'église, montrent comment la croyance et la pratique sont réinterprétées à la lumière des contextes changeants.
En résumé, la tradition présente une vision du monde cohérente mais distincte : Dieu comme infini, l'Esprit comme seule réalité, le matériel comme erreur, et la compréhension spirituelle correcte comme méthode de guérison et de renouveau moral. L'architecture théologique de la tradition et ses implications pratiques illustrent comment une seule voix interprétative — celle de Mary Baker Eddy — peut créer une grammaire religieuse durable qui s'aligne à la fois avec et s'éloigne de la tradition chrétienne plus large.