La Scienza Cristiana articola un sistema teologico distintivo incentrato sulla primazia dello Spirito e sulla convinzione, condivisa dai suoi aderenti, che una corretta comprensione spirituale possa trasformare l'esperienza umana, inclusa la salute fisica. Gli aderenti leggono la Bibbia attraverso il quadro interpretativo fornito da Mary Baker Eddy in Science and Health with Key to the Scriptures (pubblicato per la prima volta nel 1875). All'interno del movimento, quest'opera funge da compagna della Bibbia: le letture congregazionali e i sermoni abbinano frequentemente un passo biblico a una lettura dal testo di Eddy. Questo ordinamento canonico — un testo scritturale insieme alla chiave interpretativa di Eddy — organizza il contenuto dottrinale della tradizione.
Al centro della metafisica della Scienza Cristiana, insegnano gli aderenti, c'è l'idea che Dio sia Spirito infinito e che il mondo materiale, comprese malattie e morte, sia in qualche modo un'illusione o un errore. Gli aderenti sostengono che ciò che appare come malattia sia, in ultima analisi, una falsa credenza o una misconcezione sulla natura della realtà; affermano che correggere l'errore a livello di pensiero — attraverso una comprensione spirituale scientifica e preghiera — possa portare a una guarigione fisica. Il linguaggio di "scienza" nel nome della tradizione è quindi teologico: la tradizione utilizza "scienza" per inquadrare la guarigione spirituale come una pratica scoperta e simile a una legge, piuttosto che come semplice sentimento o miracolo carismatico.
Gli aderenti articolano una visione della condizione umana e della salvezza diversa da quella comune in molte denominazioni cristiane tradizionali. Mentre molte di queste denominazioni parlano spesso di peccato, espiazione e un aldilà incentrato sulla grazia divina mediata attraverso sacramenti o fede, la Scienza Cristiana riorienta il discorso sulla salvezza verso la correzione dell'ignoranza attraverso l'illuminazione spirituale. Gli aderenti enfatizzano la trasformazione morale e i frutti pratici del pensiero corretto: armonia, salute e chiarezza morale. La tradizione si colloca quindi in una tensione produttiva con le dottrine cristiane ortodosse riguardo all'incarnazione e allo stato della materia; molti Scienziati Cristiani leggono la Bibbia in modo allegorico nei punti in cui i cristiani convenzionali si aspettano letture letterali.
La Scienza Cristiana incarna un orientamento etico chiaramente articolato. Gli aderenti descrivono la vita morale come intrecciata con l'intuizione metafisica: amare Dio e il prossimo significa vivere in accordo con i fatti spirituali che Eddy descrive. Questo produce ingiunzioni pratiche che includono onestà, compassione, non vendetta e una vita disciplinata di preghiera e studio. Poiché la tradizione attribuisce un alto valore alla guarigione attraverso la preghiera, la relazione tra etica e salute diventa particolarmente prominente all'interno del movimento: i difetti morali o le credenze errate sono spesso interpretati come ostacoli alla guarigione che devono essere corretti attraverso il lavoro spirituale.
La tradizione contiene anche un'ecclesiologia distintiva. I membri della Chiesa sono organizzati in chiese ramificate e ci si aspetta che partecipino ai servizi settimanali, alla preghiera collettiva e ai gruppi di studio. Il ruolo della Bibbia e di Science and Health nel culto crea un ritmo di lettura e interpretazione che è centrale per la vita comunitaria. All'interno del movimento, viene attribuito un peso teologico insolito all'autorità degli scritti di un fondatore: i seguaci trattano il lavoro di Eddy come una chiave per le Scritture, il che solleva domande ermeneutiche continue riguardo all'interpretazione e ai limiti del commento autorevole.
Sulla questione dei sacramenti e del clero, la Scienza Cristiana differisce notevolmente da molte denominazioni cristiane. Il movimento generalmente non pratica riti sacramentali come il battesimo o la comunione nel senso tradizionale. Invece, il suo culto enfatizza letture, testimonianze di guarigione, inni e sermoni. Allo stesso modo, l'ufficio del pastore o del lettore è distinto; il clero ordinato, così come concepito in molte altre chiese, è assente nella stessa forma. L'autorità è esercitata attraverso le strutture di governance della chiesa e attraverso l'ufficio di insegnamento, ma ci sono meno segni ritualizzati che rispecchiano il cristianesimo sacramentale.
La posizione del movimento nei confronti della scienza medica e della medicina è stata tra le sue dottrine più controverse. Storicamente, la Scienza Cristiana ha insegnato che la preghiera è il principale mezzo di guarigione e ha consigliato di fare affidamento sul trattamento spirituale. Questa posizione è stata contestata all'interno del movimento, dove alcuni aderenti utilizzano le cure mediche insieme alla preghiera, ed è stata opposta da molti nella professione medica e dalle autorità statali in vari momenti. La ricerca sottolinea che gli insegnamenti del movimento non proibiscono uniformemente il trattamento medico; piuttosto, la pratica varia e i conflitti legali spesso derivano da casi specifici in cui il ricorso alla preghiera piuttosto che alla medicina è diventato una questione di salute pubblica o di benessere infantile.
Le prospettive comparative illuminano sia le affinità che le differenze. Gli osservatori notano che la Scienza Cristiana condivide con il Nuovo Pensiero e altri movimenti metafisici un'enfasi sulla causalità mentale e sulla guarigione spirituale, ma è più esplicitamente biblica rispetto a molti gruppi del Nuovo Pensiero e rivendica un fondatore unico i cui scritti sono trattati come canonici. Rispetto al protestantesimo tradizionale, la negazione metafisica del movimento della realtà ultima della materia e la sua lettura anti-materialista della malattia lo distinguono, producendo i tipi di tensioni dottrinali che hanno informato controversie pubbliche e risposte ecumeniche.
Esiste una diversità di credenze all'interno della Scienza Cristiana: alcuni aderenti leggono gli scritti di Eddy in modo più letterale, altri adottano un'ermeneutica più flessibile che consente le cure mediche; alcune congregazioni enfatizzano la tradizione delle testimonianze di guarigione, mentre altre si concentrano sull'impegno sociale o sull'istruzione. Il movimento si è anche evoluto interpretativamente attraverso le generazioni; i dibattiti del ventesimo secolo sul ruolo del linguaggio tecnico negli scritti di Eddy, o sul posto delle donne nella leadership della chiesa, mostrano come credenze e pratiche siano reinterpretate alla luce di contesti in cambiamento.
In sintesi, la tradizione presenta una visione del mondo coerente ma distintiva: Dio come infinito, Spirito come unica realtà, il materiale come errore e la corretta comprensione spirituale come metodo di guarigione e rinnovamento morale. L'architettura teologica e le implicazioni pratiche della tradizione illustrano come una singola voce interpretativa — quella di Mary Baker Eddy — possa creare una grammatica religiosa duratura che si allinea e si distacca dalla più ampia tradizione cristiana.